バイオテクノロジーにおけるプロセス質量分析

バイオテクノロジーにおける プロセス質量分析

質量分析計の分析時間によるプロセスの 適化 世界中の設置ベースにより現場で証明されたテクノロジー オンラインプロセス分析技術（PAT）の応用はバイオテクノロジー Thermo Scientific Prima PRO 工業において近年明確な努力目標となってきました。Thermo プロセス質量分析計： Scientific プロセス質量分析計は 1980 年代の初頭から発酵槽やバイ 次世代始動 オリアクターの入口、出口のガス流の成分監視の目的で発酵技術者 30年以上におよぶガス分析の経験に裏打ちされる様に、Prima によって広く用いられてきました。これら精密な測定は汚染の発生 PRO質量分析計はプロセスの各ステージに関する非常に重要な情 を事前に遮断するのと同時に、細胞の呼吸や栄養の効果に関する価 報をもたらすPATツールとなっております。プロセス設計と全生 値ある情報をリアルタイムで提供します。 産量のスケールアップにより、次世代型ガス分析計はバイオテクノ 更に 新のプロセスでは、現在、より進歩したガス分析テクノロジ ロジープロセスの多くを容易にし、運転の効率化を可能にします。 ー環境が有効です。新しいThermo Fisher Scientific Prima PROプ すなわち： ロセス質量分析計は過酷な工業環境における閉ループ制御で高い ・ 接種前の汚染の高速確認を実施 ・ シードタンクからの接種物の転換を 適化 信頼性を確保し、故障に耐える運転を行える 新の設計技術を備え ・ 代謝活動を監視 ております。 ・ タイムリーな予測値（サンプル投与中止の必要なしに）与える 状態方程式への入力を提供 － 活性細胞量 － グルコース消費率 － 培養基濃度 － アルコール生成率 － 生産物抑制 ・ 養成神経ネットワークとハイブリッドモデルの為のデータ提供 ・ 環境規準に適応する為除去する必要のある成分を同定し限定 ・ 下記の制御を可能にするkLaの変化を監視する － 撹拌回転数 － スパージガス流量 － スパージ酸素濃度 ・ 溶存酸素プローブのドリフトを検知し、その大きさを測る ・ 代謝指標の監視： － メタノール － エタノール － アセトン － アンモニア ・ 特定の代謝を示す可能性のある新しい種類の分子を同定 Prima PROプロセス質量分析計は無菌状態を汚染することなく全 てを行います。それは１台の分析計で60の発酵槽やバイオリアク ターを監視することにより、著しく生産性を上げ、装置のメンテナ ンスを削減します。 有意義な投資対効果をもたらす新モデル ・ プロセスのダイナミックな変動を高精度で追跡する高速オンラ イン分析（1点当り1~20秒） ・ 包括的で進歩的なプロセス制御モデル（APC）の為の多くのデ ータを提供 ・ 校正間隔30-90日（自動）の安定性 ・ 有効率99.7%の信頼性と耐故障設計 ・ 大型のシェルターを必要としない小さい設置スペース ・ 運転コストを削減する 小のメンテナンス部品

動作原理 これは四重極方式の非常に低いイオンエネルギーと比較する時、こ Prima Pro は強力で自在性に富む走査磁場型質量分析計をベースと の方式の質量分析計の故障許容性を更に高めます。 後に、高エネ する高性能ガス分析計です。装置は高い信頼性と 小限の保守備品 ルギーはイオン化領域からの引出が早く（低エネルギー重極より） によって優れた分析性能を発揮するよう設計されています。 イオン分子相互作用が減り、リニアリティーが改善されます。0.01% の長期間の再現性が容易に達成されます。 質量分析計は中性のサンプルガス分子をイオン化することによって 動作し、それらの分子の重さによって生じた荷電粒子を選別します。 多くの市販されているガス分析用質量分析計ではイオン化は熱フィ ラメントによって作られる電子ビームでガスサンプルに衝撃を与え 多流路インレット ることによってなされます。衝突を避けるため種々のイオンは真空 多くのPrima Proシステムは高速多点サンプラー（RMS）を備えて 中で選別されます。 います。これは分析計に送られるサンプルの質を落とすことなくサ ンプル流路を切り替える信頼性の高い装置です。 Fig.1 : 分析部 – 動作原理とピーク図 RMSは僅かの或は保守なしで年に600万回（年1年と）の流路切換 えの証明された性能をもって極めて堅固な信頼性の長期の記録をも っています。これは1台のMSで63の発酵槽又はバイオリアクター を監視できることを示します。ステッパーモーター駆動装置は同時 に 1 つのサンプル流路を質量分析計に振り向け、順番に各流路の流 量を記録します。装置は 120℃まで加熱でき、メタノール、エタノ ール及びアンモニアのような極性を持つ物質の応答を早くするよう 設計されています。 Fig. 2 : 分析部と64ポート高速多点流路サンプラー 1年に6,000,000回流路切り替えを行いますが、 ノーメンテナンス イオンを分別する為に導入された技術としてPrima PRO質量分析計 では可変磁場によりイオンの軌道を制御する走査磁場を採用してい ます。これにより関心のあるイオンは一つの検出器に連続的に集め られ、分析計は既知の成分を正確に定量し、未知のものを同定する 為に全てのガスサンプルのスキャンを可能にします。検出器アセン ブリはパーセントレベルや高ppmのガス濃度を測定するファラデー カップ検出器を内蔵しています。二次電子増倍管（SEM）検出器は 低ppmやppb濃度を分析するためファラデーカップと共に用いられ ます。 走査磁場からの出力信号は各々の質量のイオンの数に比例した大き さを持つ一連のフラットトップピークとなります。完全に左右対称 のピークがPrima PROプロセス質量分析計を用いれば容易に得られ ます。正確な強度測定は各ピークが一貫した大きさを持つ目標とな るので正確なピーク飛越に依存しません。マスポジションの比較的 大きなズレでさえも大きさ測定の大きな誤差にならないので、Prima PRO プロセス質量分析計の磁場では本質的に誤差範囲として記述さ れ得るものです。更に領域はコンタミから生じる避けられない部分 的な表面電荷や絶縁層によって容易に偏向されない比較的高いエネ ルギーイオンビーム（1 KV）を用います。

数日で利益に変えるガス分析計 工業による発酵及び細胞培養 発酵は工業では多くの重要な用途があり、厳密に言えば、嫌気性生物の工程を示すものです。 工業における発酵は一般的に高酸素化された媒質で働く生きた細胞を用いて有機物を分解する ことや、他の物質に変換することを表します。微生物発酵はしばしば極端な条件でも成長する 原生物質やバクテリア、菌類及び原生動物にも当てはまります。細胞培養という言葉は もし ばしば植物、昆虫及び哺乳動物の細胞のような高い順位の者にも使われます。微生物発酵と細 胞培養との区別は丈夫なバクテリアは温度、pH及び撹拌と曝気によって生じる偏向力の厳密な 制御を必要とする哺乳動物細胞よりもプロセス変化に対して許容性があるのでプロセス制御の 観点から重要です。溶存二酸化炭素の制御も細胞培養制御には重要です。 新のガス分析テク ノロジー装置を基に、Prima PROプロセス質量分析計はリアルタイムで情報を提供する為に設 計され、工業用の発酵や細胞培養における厳格なプロセス制御を可能にしています。 Prima PRO プロセス質量分析計: 多才、高い信頼性、容易なメンテナンス 多才なPrima PROプロセス質量分析計は製品の生産増加のみならず、製品管理全体の改良の為、 多くのバイオテクノロジープロセスの 適化を可能にします。フルスケール生産で運転する為、 スケールアッププロセスの各段階を促進し、以下の複合的な製造に関連するリスクを軽減します。 ・ バイオエネルギー ・ 工業的酵素 ・ 生体適合物質 ・ バイオマス ・ 食品添加物 ・ ビタミン ・ 医薬 － 予防薬 － ワクチン － 発育因子 － モノクロナル抗体 － ホルモン － 融解蛋白質 － 細胞分裂 － 抗生物質 － インシュリン － 血液凝固剤

簡単なバイオリアクターの制御 従来の小分子合成と比較した時、生化学プロセスは非常に複雑です。 て酸素が加えられます。哺乳動物細胞培養の場合、同様の制御方法 各細胞は 1 秒間に多くの化学反応を行う能力を持っており、しばし が溶存二酸化炭素（DCO2）に用いられます。統計的なプロセス制御 ば、それらの反応のたった一つが目標分子を作る結果となります。 （SPC）ツールはプロセスがラボ分析から手動で入力されたデータ どのように反応が進んだかは温度、栄養素の効果、蓄積された廃棄 に基づいた適切な軌線を追随しているかどうか決定するのに用いら 物の量、利用できる酸素、反応を推進する酵素の濃度及び作られる れます。これらのデータは又収穫に適する時を決めるのにもつかわ 蛋白質からのアミノ酸基礎単位のような主要なファクターによって れます。これらの状況の下で、バッチ毎の変化は著しく、差の大き 決定されます。簡単な発酵槽の場合、培質は滅菌に次いで充填され、 さのレベルは異常ではありません。製薬製品の場合、もし回収され ブロース（broth）は細胞と共に接種されます。比較的安定なスパー た実際の製薬材料（API）が一定の品質基準以下であった場合、全バ ジガス流量とインペラー回転数は媒質を通して十分な酸素量を確実 ッチは廃棄されねばなりません。明らかに信頼度の高いオンライン に保持します。細胞が繁殖し始めると過剰な熱は冷却水によって除 PAT を持つPrima PRO プロセス質量分析計は製品品質と収益性を かれ pH の調整は酸とアルカリ試薬を用いてなされます。溶存酸素 改善する為に必要なツールをご提供します。 （DO2）は連続的に監視され、手動分析は細胞密度と培養基の組成 を取り込みます。 もしDO2が予定のレベル以下に下がれば、短時間酸素バルブを開い Fig. 3 : バイオリアクターの制御例

リアルタイムでのバッチ経過を追跡 Fig. 5 : オートクレーブ型ベンチトップ培養装置 プロセス変化量 生物学的生産に用いられる殆どのバクテリアはそれらが成 長し、分割する前に水、炭素、窒素及びエネルギー源が必要 です。前に述べたように、それらはまた温度、pH 及びガス 供給も含まれます。栄養素は幾つかの自然生産物（Fig.4 参 照）を含む可能性のある複雑な成長媒質又は自然のバッチ間 変化が示す問題があるプロセスで化学的に明らかにされ得 る媒質に備えられます。両タイプの媒質は目標細胞の密度が 達成されるまで急速な対数的成長を促進するため 適な濃 度の栄養素を供給するよう設計されます。この時点で、 初 の炭素源は製品形成を進める第二の栄養源に切り替える為、 細胞に強力に消耗させることになります。追加成分は製品生 成を 大にし、毒性のある副産物の蓄積を 小にするため抑 制又は特定の代謝経路を促進します。 Fig. 4 : 成長媒質の構成 プロセスのスケールアップ プロセス開発の典型的な手順では1－10Ｌ/min レンジ の容量を持つ多様なベンチトップバイオリアクター又 は発酵槽の使用を含みます。種々のブロースレシピは も活発で効果のある組み合わせを決める為に異なる 細胞系と組み合わされます。一度 適な候補グループ が選択されると、プロセスは 200L スケール（パイロ ットスケール）までスケールアップされます。これは 重要な制御変化量が許容範囲と効力を完全にテストさ れるところです。pH、温度、撹拌回転数、DO2 及び DCO2 に加えてポテンシャル制御変数も含まれるかも しれません。 ・ 栄養素供給率 ・ 背圧 ・ 上掛けガスの組成 ・ スパージガスの組成と流量 プロセス質量分析計： リアルタイムモニタリング及び制御 リアルタイムで栄養素を供給し、ガス組成を制御する 為、ブロースの化学的性質又は反応機排出ガスのリア ルタイムの組成分析の両方が必要です。 新のプロセ ス制御技術をベースとするモデルは一定の出力変数の 測定された変化に応じてこれらの追加的な制御変数を 変化させるのに用いられます。フーリエ変換近赤外 （FT-NIR）スペクトルは液体濃度を測定する為に適し た技術です。ガス濃度測定をおこなうのに 良の技術 は磁場型質量分析計で、分析能力と柔軟性を大きく引 き出す Prima PRO プロセス質量分析計の決定的な要 素です。

新バイオリアクター ダイナミックモデル アドバンスドコントロール技術 細胞量、製品濃度（滴定濃度、力価）及び培養基を測定する為 予測制御モデル（MPC）を実行するための前進的な方法は幾つか浮かび上が に も頻繁に用いられる方法は微分方程式の使用を想定してい ります。これらのモデルは一定の形式によった（決定論的な）モデルと人工 ます。これらの状態方程式は互いに依存し、初期条件とリアル 的な神経ネットワーク（ANN）とのハイブリッドな組み合わせができます。 タイム測定に基づく妥当な結果を生ずる為に同時に解決されね 基本的に、ANN モデルは一義的な分析ができない場合のギャップを埋めま ばなりません。初期条件は培養基の量（初期炭素源）、開始細 す。それらはそう呼ばれます何故ならそれらの構造は相互に接続された節、 胞量、ブロース（broth）量などを含みます。リアルタイム測定 脳のニューロンに類似の構造、の層に基礎を置かれます。これらのネットワ は酸素摂取率（OUR）、二酸化炭素生産率（CER）、呼吸商（RQ） ークモデル動作は歴史的機能に基づきます。大きなトレーニングデータセッ 及び溶存酸素測定値を含みます。モデルからの出力は 適な製 トはしばしば統計の成果は特定の範囲内で特定のプロセス変数降下の結果で 品構成物のための理想的なプロフィールを規定するゴールデン あることを示します。結合の正式な説明を導き出すのは非常に難しいかもし バッチの既知の軌跡を持つ結果との比較によって各バッチの経 れませんが、これらの関係はプロセス制御に未だに用いられています。質量 過を追跡する為に用いられます。この方法は制約する条件及び 分析計によるバイオリアクター排出ガスの広範な分析は神経ネットワークの コンタミネーションができるだけ早く定められ補正され得るこ ような訓練を受けて用いられるデータを提供することができます。他の数学 とを保証します。 的モデリング技術は元素成分分析（PCA）及び部分 小二乗法（PLS）回帰 を含みます。これらは大きなデータセットにおける調査様式及び関係の数学 的手順です。データ収集を容易にすることにより、Prima PROプロセス質量 分析計はMPCの実行において成功するカギとなっております。 Fig. 6 : Prima PRO質量分析計により可能なモデル予測制御型高度バイオリアクター

汚染と成長する細胞集合体の 大化を正確な見極め 新バイオリアクターモニタリング Fig. 7 : Prima PROプロセス質量分析計による酸素（O2）安定性プロット 質量分析計データの特性 表1：Prima PROプロセス質量分析計の酸素測定の統計値 Prima PRO Fig.7 分析 データ % 絶対標準 相関標準 は の酸素安定性プロット及び表１の関連統 時間 ポイント 平均 偏差 偏差 計データから見られるように非常に精密な測定を行います。 Prima PROプロセス質量分析計は発酵槽がドライエアで散布 3秒 9,598 20.949 0.00268 0.01281 される時、50ppm 以下の酸素消費を容易に検出できる為、 30秒 960 20.949 0.00134 0.00642 21%O2 を 30 秒分析した際の標準偏差は 13ppm はとなりま す。この測定はバクテリアの呼吸がスパージガスの組成と排出 ガスの組成とを比較することによって検出できるので接種前 表2：代表的なPrima PROプロセス質量分析計データ の汚染を確認するのに非常に有効です。酸素濃度の僅かの減少 分析値 Bio 1スパージ Bio 2排出ガス が二酸化炭素の同様のmol%増加に関連がある時、バクテリア 窒素 78.082% 78.081% 汚染が明らかに示されます。 酸素 20.951% 18.735% ガス流路中の各成分の濃度測定に費やす時間はソフトウェア アルゴン 0.939% 0.939% によって構成され、モニターされる各プロセスのサンプルポイ CO2 0.028% 2.244% ントの数と動的特質によって変わってします為、分析速度と精 メタノール 450.010 ppm 度との同時に満たしています。通常の分析時間は窒素、酸素、 エタノール 173.156 ppm アルゴン及び二酸化炭素の測定で5秒、更にメタノールとエタ 酢酸 0.001 ppm ノールの測定には3秒加算され、フラッシング時間5秒を加算 して流路毎の全分析時間は10秒（メタノールとエタノールを アセトン 0.000 ppm 含む場合は13秒）となります。哺乳動物細胞の培養では状態 H2S 17.429 ppm 変化は微生物発酵において進行するよりもゆっくりであるの OUR 2.216 で、バイオリアクターでは発酵槽よりも分析回数を少なくして CER 2.216 精密にモニターできます。 RQ 1.000 サンプル流量 250.713 mL 180.655 mL

酸素摂取率（OUR） Prima PROプロセス質量分析計によって得られるスパージガスと反 開始を明確に示しています。この場合、問題はグルタミンの減少で 応槽排出ガスの酸素濃度はプロセス制御コンピューターに送られま した。 す。そのデータは培養菌の酸素摂取量の計算のため流量測定とバッ チの量と結合されます。 酸素量転換率（kLa）の計算式 酸素摂取率（OUR）の計算式 OUR 流出量 kLa = スパージ流量 ｘ (スパージO - ) (DO2@ 平衡値 – DO2 測定値) OUR = 2 流出O2 液量 上記の式はガス状の酸素が液媒質を介して転換される効率を示して います。これは発酵の進行時に撹拌機やスパージャーを設計する際 OURのリアルタイムでの計算はしばしばシードタンク内の活性細 に回転数やスパージガスの流量を設定するために知る重要なパラメ 胞の密度を決めるのに用いられ、植付けに適切な時間が決定するこ ーターです。質量分析計が使用されない時、活動的な体系は溶存酸 とができます。 素がDO2プローブを用いてモニターされる間に酸素レベルは広く変 Fig.8ではPrima PROプロセス質量分析計を用いたOURオンライン 化します。Prima PROプロセス質量分析計を用いれば、OUR測定 をモニターした値を表しています。一見したところでは、黄色の曲 は連続的なkLaの推測を可能になります。酸素量転換はブロース 線は単に細胞の密度を示している様に見え、そのバッチが正常に進 （broth）の密度が変化する様に変化するでしょう。そこで微生物学 行している事を想定している様に見えます。増加の割合において小 者はパイロットスケールに移る前にこの関係を理解する必要があり さな変化を除けば、そこでは個体数の健全な増加がみられます。た ます。kLaの動特性が理解されれば、通常の軌道からのズレはDO2 だ残念なことに、細胞の死亡率の増加により70時間で細胞の生存力 プローブのドリフトを検知し補正するのに用いることができます。 の著しい低下がみられ、死滅した細胞は価値を持ちません。細胞の kLaでの変動をモニターすることにより、Prima PROプロセス質量 生存力は入力としてOURを必要とする状態変化となります（死んだ 分析計は撹拌機の回転数やスパージガスの流量、スパージ酸素濃度 細胞は呼吸もしません）。Prima PROプロセス質量分析計によって の制御を容易にします。 得られた OUR曲線は原因が分かればすぐに補修できる制限状態の Fig.8: Prima PROプロセス質量分析計による10L ハイブリドーマ曲

1台の分析計で60基以上の培養槽やバイオリアクターをモニター 二酸化炭素放出と細胞の呼吸 出口ガス分析から計算される も重要な変数は呼吸商（RQ）で 窒素とアルゴンの比は水蒸気の飽和とバイオリアクター放出ガス す。これは発酵と細胞培養－成長と維持の両方に現れる二つの の希釈によって起こる分圧変化を補正します。 例えば、RQ = 1 は成育段階でのエネルギー生成用のグルコースの 別々な形の作用です。RQは二酸化炭素放出率（CER）割る酸素 酸化です。 摂取率（OUR）として表されます。Prima PROプロセス質量分 析計は現行の代謝活動を測定し、グルコース供給率（GFR）を含 (CH2O)n + nO2 => nCO + nH O + エネルギー 2 2 むある種の変数の閉ループ制御を潜在的に可能にすることに用 （ATPの方式にて） いられるRQのタイムリーな推定値を提供できます。 例えばRQ = 0.7の場合、菌類の発酵の生産段階でしばしばエネル ギーを供給するステアリン酸の酸化に由来します。 ガス状窒素を固定しない発酵におけるRQ 結果、CO2の18分子をO2の26分子で割ることからもたらされ スパージN ( 放出CO2 x 2 ) - スパージCO N 2 ます。 放出 RQ = 2 スパージN スパージO2 - ( 放出O2 x 2 ) C H O + 26O => 18CO + 18H O + エネルギー 放出N 18 36 2 2 2 2 2 ガス状窒素を固定した発酵におけるRQ Fig.9は代謝が脂肪酸炭素源に切り替わった時、発酵中50時間での スパージAr ( 放出CO2 x ) - CO 明らかな培養基の消耗を示します。 スパージ 2 放出Ar もしOURが十分な活性細胞の密度を示すならば、発酵は続行可能 RQ = スパージAr です。さもなければ、成育段階を延長するために自動的なグルコー スパージO2 - ( 放出O2 x ) 放出Ar スの添加が開始されます。 Fig.10はPrima PROプロセス質量分析計により得られるRQ 予測 値が原料供給バッチ発酵槽で活性細胞を 大にするためグルコー ス添加のトリガーに用いられた場合の結果を示しています。 Fig. 10：Prima PROプロセス質量分析計によって得られた Fig.9 : 200L菌類発酵のRQ曲線 200 L 原材料バッチ発酵槽でのRQ 曲線

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